На основании Указа Президента РБ от 22 октября 1996 г. № УП-68 и Распоряжения Кабинета Министров от 30 мая 1997 г. № 516-Р, Приказа Министра культуры РБ от 6 января 2000 г. № 2 Национальный литературный музей РБ создан как научно-просветительское, пропагандистское учреждение и как государственное хранилище уникальных памятников древней и современной литературы. Это было необходимо для системного, комплексного изучения, освещения различных этапов многовекового литературного процесса в Башкортостане, ознакомления широких слоев населения с длительным путем становления и развития башкирской литературы и литературы народов Башкортостана, способствовать их духовному обогащению и сближению.
На сегодняшний день в состав Головного музея входят пять филиалов:
1) Мемориальный дом-музей М.Гафури – г. Уфа, ул. Гоголя, 28;
2) Музей М.Акмуллы – д. Туксанбаево Миякинского района;
3) Музей Ш.Бабича – д. Асяново Дюртюлинского района;
4) Музей М.Уметбаева – д. Ибрагимово Кармаскалинского района;
5) Музей А.Мубарякова – с. Ассы Белорецкого района.