Бурятский ученый комитет — первое научно-исследовательское учреждение республики — был создан в Улан-Удэ в 1922 году, в 1958 году он был реорганизован в Бурятский комплексный научно-исследовательский институт АН СССР и вошел в состав Сибирского отделения. В 1966 году на его базе было организовано несколько институтов, которые составили Бурятский филиал, сегодня — Бурятский научный центр (БНЦ) СО РАН.
Научная тематика Центра направлена на изучение и сохранение духовного наследия и природных ресурсов региона, разработку методов устойчивого природопользования и поиск решений, нацеленных на развитие экономики в бассейне озера Байкал.
В настоящее время БНЦ СО РАН территориально объединяет следующие научные организации:

Байкальский институт природопользования СО РАН (http://www.binm.ru)
Основные направления фундаментальных исследований:
Проблемы природопользования: взаимодействие природных социально-экономических систем.
Химические элементы и соединения в природных и искусственных средах.
Создание новых материалов и ресурсосберегающих, экологобезопасных технологий; химические аспекты рационального природопользования.

Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН (http://igeb.ru/)
Основными направлениями научной деятельности Института в настоящее время являются: Структура, функционирование и эволюция наземных и водных экосистем, их биологическое разнообразие.
Проблемы сохранения и использования биологических ресурсов.

Геологический институт Сибирского отделения РАН (http://geo.stbur.ru)
Основными направлениями научной деятельности Института в настоящее время являются:

Эволюция тектонических структур, магматизма и рудообразования в различных геодинамических обстановках складчатых поясов
Геоэкология Байкальского региона

Институт физического материаловедения СО РАН (http://ipms.bscnet.ru/)
Основными направлениями научной деятельности ИФМ СО РАН в настоящее время являются:
новые функциональные материалы и покрытия, новые технологии их получения;
радиофизические методы диагностики природных и искусственных материалов и сред.

Институт монголоведения, буддологии и тибетологии СО РАН (http://imbt.ru/)
Основными направлениями научной деятельности Института в настоящее время являются:

Фундаментальныe проблемы гуманитарных исследований, связанные с долгосрочной стратегией сосуществования народов, взаимодействия этносов и культур в полиэтничных регионах.

Центр восточных рукописей и ксилографов ИМБТ СО РАН (http://imbtarchive.ru/)
Кропотливый многолетний труд бурятских ученых-востоковедов позволил сформировать в ИМБТ СО РАН одно из крупнейших в мире собраний тибетских и монгольских памятников письменности, уникальных архивных документов, памятников фольклора, представляющее собой национальное достояние Российского государства.

Отдел региональных экономических исследований при Президиуме Бурятского научного центра СО РАН (http://www.oreibsc.ru/)
Основными направлениями научной деятельности ОРЭИ в настоящее время являются: экономические взаимодействия трансграничных территорий стран Восточной Азии;
межотраслевые взаимодействия в экономике региона;
создание прогнозно-мониторинговой системы Республики Бурятия;
человеческий потенциал и проблемы миграции.